蛋白质片段识别出两种新的极端微生物可能有助于寻找外星生命
完美适应的微生物生活在从深海海沟到山顶的极端环境中。更多地了解这些极端微生物如何在恶劣的条件下生存，可以让科学家了解地球上的生命和其他行星上潜在的生命。在 ACS 的《蛋白质组研究杂志》中，研究人员详细介绍了一种基于蛋白质片段而不是遗传物质来更准确地识别极端微生物的方法。这项研究从智利高海拔湖泊中发现了两种新的耐寒细菌——这里的环境类似于早期火星。
尽管人类倾向于避免在极热、极冷或高海拔地区定居，但一些微生物已经适应了在如此恶劣的地方生活。这些极端微生物引起了在其他行星上寻找生命的天体生物学家的兴趣。研究人员目前使用个体基因测序来根据 DNA 识别地球上的微生物。然而，目前的方法无法区分密切相关的极端微生物物种。因此，拉尔夫·莫勒(Ralf Moeller)及其同事研究了是否可以通过使用其蛋白质特征而不是基因序列来识别极端微生物。
研究人员开始使用来自智利高原海拔超过 2.3 英里的五个高海拔安第斯湖泊的水样进行演示。(作为参考，丹佛海拔约一英里。)研究人员从样本中培养了 66 种微生物，然后确定两种方法中哪一种能更好地识别微生物：
传统的基因测序将每个样本的 16s rRNA 基因(基于序列的微生物分析的典型基因)的核苷酸与数据库进行比较以进行识别。
较新的“蛋白质分型”技术分析了称为肽的蛋白质片段，以产生肽特征，该团队利用这些特征从蛋白质组数据库中识别微生物。
通过这些方法，研究人员鉴定出了从高海拔湖泊样本中培养的 66 种微生物中的 63 种。对于基因测序未能识别的三种微生物，因为它们的遗传信息不在可用的数据库中，蛋白质分型识别出了两种潜在的新型嗜极细菌。这些结果表明蛋白质分型可能是从小型生物样品中识别极端微生物的更完整的解决方案。研究小组表示，蛋白质分析有朝一日可以帮助我们寻找和识别外星生命，并更好地探索我们星球上的生物多样性。
版权声明：本文由用户上传，如有侵权请联系删除！