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恢复现代番茄中丢失的STP1变体以改善果实中的可溶性固形物

摘要 核心内容:在这项研究中,作者对由 481 个具有较大自然变异的番茄种质组成的种群中的红熟果实 SSC 进行了全基因组关联研究 (GWAS),并

核心内容:在这项研究中,作者对由 481 个具有较大自然变异的番茄种质组成的种群中的红熟果实 SSC 进行了全基因组关联研究 (GWAS),并发现了一个新的数量性状位点 STP1,编码一种糖转运蛋白。位于起始密码子上游 1,124 bp 启动子区域的 21-bp InDel 的因果变异会改变其表达。具有 21-bp 插入的STP1插入种质比具有 21-bp 缺失的STP1删除种质具有更高的 SSC 使用 CRISPR/Cas9敲除具有高 SSC 的 TS-23 中的STP1大大降低了果实中的 SSC。体内 和体外 化验表明 ZAT10-LIKE 是一种锌指蛋白转录因子 (ZFP TF),可以特异性结合STP1插入启动子 以增强STP1表达,但不能结合 STP1 缺失启动子,导致现代番茄果实 SSC 降低。多样性分析表明,STP1 是在番茄改良过程中被选择的。

创新:作者确定了番茄 SSC 中自然发生的因果变异,以及 ZFP 转录因子在调节糖转运蛋白中的新作用。该研究结果丰富了对番茄进化和驯化的认识,为培育美味番茄提供了遗传基础。

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